JN0094 100bp DNA Ladder

產品簡介
我公司致力于為客戶提供高純度、低成本的活性重組蛋白,包括100bp DNA Ladder在內的各類受體、細胞因子、生長因子、轉錄因子、激素、酶、毒性蛋白、病毒抗原等。...
產品詳細介紹
特別提示:包括100bp DNA Ladder ODD Plus在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:100bp DNA Ladder ODD Plus
產品貨號:JN0094
產品規格:500μl(100次)
本DNA Marker為預混1×Loading Buffer的DNA溶液,可直接電泳。100bp DNA Ladder ODD Plus在100bp DNA Ladder ODD基礎上增加了2000bp和3000bp兩個條帶。
片段組成:
100bp,300bp,500bp,700bp(加亮),900bp,1100bp, 1500bp,2000bp,3000bp,其中500bp條帶濃度加倍,約為30 ng/μl,顯示為亮帶,使電泳結果更容易辨認,亦可用于定量。
儲存條件:-20℃,有效期2年。
圖1:DNA Marker電泳圖

圖2:DNA Marker條帶示意圖

表1:DNA Marker選擇指南
目的條帶分子量范圍 (推薦瓊脂糖%) | 標準分辨率 | 高精分辨率 |
1500bp以下 (1.0%到2.0% Agrose) | 200bp DNA Ladder | 100bp DNA Ladder |
200bp DNA Ladder Plus | 100bp DNA Ladder Plus | |
100bp DNA Ladder ODD | DNA Ladder 2000 Plus | |
100bp DNA Ladder ODD Plus | DIY DNA Marker(條帶任選) | |
DNA Ladder 2000 | ||
1500bp以上 (0.7% Agrose) | DNA Ladder 3000 | 1kb DNA Ladder I |
DNA Ladder 5000 | 1kb DNA Ladder II | |
DNA Ladder 9000 | 1kb DNA Ladder Plus I | |
DNA Ladder 10000 | 1kb DNA Ladder Plus II | |
λ/Hind III DNA Marker | DIY DNA Marker(條帶任選) |
表2:DNA Marker系列一覽表
DNA Marker | 條帶組成(bp) | 瓊脂糖(%) |
100bp DNA Ladder | 100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000 | 1.5% |
100bp DNA Ladder Plus | 100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、1200、1500、2000 | 1.0% |
100bp DNA Ladder ODD | 100、300、500、700、900、1100、1500 | 1.5% |
100bp DNA Ladder ODD Plus | 100、300、500、700、900、1100、1500、2000、3000 | 1.0% |
200bp DNA Ladder | 200、400、600、800、1000、1200、2000 | 1.5% |
200bp DNA Ladder Plus | 200、400、600、800、1000、1200、2000、3000、5000 | 1.0% |
DNA Ladder 2000 | 100、250、500、750、1000、2000 | 1.0% |
DNA Ladder 2000 Plus | 100、250、500、750、1000、2000、3000、4000、5000 | 1.0% |
DNA Ladder 3000 | 100、250、500、750、1000、1500、2000、3000 | 0.7% |
DNA Ladder 5000 | 100、250、500、750、1000、1500、2000、3000、5000 | 0.7% |
DNA Ladder 9000 | 500、1000、2000、3000、5000、9000 | 0.7% |
DNA Ladder 10000 | 500、1000、2000、4000、7000、10000 | 0.7% |
1kb DNA Ladder I | 500、1000、 2000、3000、4000、5000、6000、8000 | 0.7% |
1kb DNA Ladder Plus I | 100、250、500、750、1000、1500、 2000、3000、4000、5000、6000、8000 | 0.7% |
1kb DNA Ladder II | 500、1000、 2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000 | 0.7% |
1kb DNA Ladder Plus II | 100、250、500、750、1000、1500、 2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000 | 0.7% |
λ/Hind III DNA Marker | 125、564、2027、2322、4361、6557、9416、23130 | 0.6% |
DIY DNA Marker(條帶任選) | 100、200、250、300、400、500、600、700、750、800、900、1000、1100、1200、1500、 2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000等24個fregment任選 | 詳情請參考說明書 |
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貨號 | 名稱 | 規格 |
BTN90313 | TBE電泳液,10× | 250mL |
BTN70503R | DNA marker(100-2000bp) | 50次 |
BTN70503Y | DNA marker(100-5000bp) | 50次 |
BTN120654F | Southern DNA Marker Oligo(DIG標記) | 20次 |
BTN110801 | 核酸濃縮劑 | 30mL |
YT418 | DNA上樣緩沖液(6X) | 2ml |
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名稱:綠如藍核酸染料(UV)
貨號:BTN70303
規格:1.5mL
目前zuì常見的替代EB的核酸染料SYBR Green I(屬于花氰類染料)雖然毒性比EB低、靈敏度比EB高,但由于其化學穩定性差(怕光、怕水、怕熱),實驗結果的重復性往往不盡人意;此外,SYBR Green I在電泳過程中能在DNA分子間移位,很容易使DNA 條帶模糊和扭曲,電泳清晰度和分辨率也不如EB。所以在實際應用中依然不能有效替代EB。本產品是同時具有EB 穩定性和SYBR Green I低毒性的新性核酸染料
產品特點:
1.低毒。其主要成分未發現對人體有致癌性、未被列入有毒有害品,有利于保護使用者的健康和保護日益惡化的環境。
2. 靈敏。檢測靈敏度跟EB相當,能滿足常規核酸電泳實驗要求。
3. 穩定。對光、水和熱的穩定性跟EB相當,可加入瓊脂糖凝膠中反復熔化。
4. 無分子間位移現象。不會出現SYBR染料常見的條帶模糊和扭曲現象。
5. 使用方法多樣。既可以加入熔化的膠中,也可以電泳后染色,還可用于PAGE。
6.跟各種常用的核酸電泳緩沖液(如SuperBuffer-2、TBE、TAE)兼容,但在SuperBuffer-2和TBE中背景zuì低。
7. 觀察時不需要任何額外的儀器設備或UV光源,可以使用現成的觀察EB的300nm UV。
8.可用于RNA染色(也呈綠色)。
9. DNA或RNA濃度較高時還可以直接在日光下觀察(需要將膠放在黑色背景下)。由于避免了UV 對DNA的傷害,尤其適用于膠回收實驗。
儲存條件:常溫運輸,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
注意:雖然本產品的主要成分未發現對人體有致癌性、未被列入有毒有害品,但操作時zuì好還是戴上塑料手套。
使用方法之一:電泳中染色DNA(RNA的染色跟DNA完全一樣)。
本方法是將DNAGREEN 直接加入溶化的凝膠中使用,只適用于瓊脂糖凝膠電泳,不適用于PAGE。
1. 將DNAGREEN 直接加入到融化的瓊脂糖凝膠中,每100mL凝膠加3-10μl DNAGREEN,混合均勻后倒膠。瓊脂糖凝膠中不能含任何其他染料(如EB和SYBR Green I,否則會相互干擾)。在100mL 瓊脂糖凝膠中加入DNAGREEN的量不要超過10μl,否則背景將很強。注意:一定要保證瓊脂糖徹底熔化,尤其是在次熔化膠的時候,否則未熔化的小顆粒將產生跟染料相同的熒光。
2. 將DNA樣品與DNA上樣液按比例混合后上樣。注意:一定要使用不含SDS等去污劑的上樣液,否則SDS 會跟染料結合,大地降低靈敏度。
3.上樣后電泳,電泳參數同常規的電泳。如果使用百奧萊博五分鐘核酸電泳液SuperBuffer-2,需要較高電壓,詳見該產品說明書。
4.電泳結束后在300nm左右的UV下觀察。注意:不要使用波長為260nm或360nm的UV,否則檢測靈敏度會降低。如果DNA或RNA濃度較高,還可以直接在日光下直接觀察(需要將膠放在黑色背景下),避免UV 對DNA的傷害,尤其適用于膠回收實驗。
注:顯色結果:在紫外下,DNA濃度非常高的時候是白色,濃度低的時候是綠色的,單鏈核酸有時是紅色的。
5. 用配置了520-550nm 濾光片(一般呈黃色或深黃色)的相機拍照。注意:不要使用與EB 兼容的紅色濾光片(它能阻擋520-550nm的光)。如果能再加上能濾去UV的濾光片,效果會更好。
6.后續 Southern、轉膜或DNA膠回收實驗按常規操作進行。
使用方法之二:電泳后染色DNA
本方法是在電泳后對DNA進行染色,適用于瓊脂糖凝膠電泳和PAGE。但該方法需要單獨的染色處理,染料用量較大,不推薦用于瓊脂糖凝膠的染色。
1. 按照常規方法進行電泳。
2. 用去離子水將DNAGREEN 稀釋500倍后(100mL 水需要加0.2mL DNAGREEN),將凝膠放入,室溫下搖晃染色30分鐘(對瓊脂糖凝膠)或15分鐘(對PAGE)。
3. 用水脫色 10-30分鐘,具體時間需根據背景強弱決定,其余同方法一。
注意:電泳后染色液可以反復使用次數。
疑難解答:
Q:本產品可否用于RNA染色?
A:可以,不論RNA是在甲醛變性膠中電泳,還是在普通的SuperBuffer-2、TBE或TAE膠中電泳,RNA染色后在300nm下都跟DNA一樣呈綠色。
Q:本產品是否可以加入上樣液中進行染色?
A:不行,本產品只能直接加入凝膠中進行染色或電泳后再染色。
Q:為何前端(靠近正)的DNA 條帶很淡或根本看不見?
A:跟EB一樣,電泳時DNAGREEN 朝負方向移動,當前端的DNA(zuì小片段)進入沒有DNAGREEN的區域時,已經結合的染料分子會逐漸從DNA分子上脫落,所以條帶會變淡或根本看不見。解決辦法之一是縮短電泳時間或電泳后再染色;之二是在每100mL電泳緩沖液中補加3-5μL染料。
Q:本產品在哪種緩沖液中效果zuì好?
A:DNAGREEN染料在不同緩沖液中背景熒光強度不同,從弱到強的順序是:
SuperBuffer-2、TBE、TAE。在背景較強的緩沖液體中,可以適當降低染料的用量,比如100mL膠中加3-5μl。zuì佳濃度需要稍做摸索。
Q: 為何電泳后前面部分(靠近正)的膠呈白色,后面的膠呈黑色?
A: DNAGREEN染料帶正電,電泳時往上走,膠的黑色部分是染料上移后留下的無染料膠。
本產品在TAE中背景zuì強,可參考上個問題答案更換電泳液以降低背景值。
Q:用SYBR染色的DNA在電泳時為何容易發生條帶模糊和扭曲現象?
A:SYBR染料一般與DNA的小溝結合,但在常規電泳條件下該結合并不牢固,染料分子可以在標記的和未標記的DNA分子之間轉移,使DNA分子的泳動速度時快(無染料結合時)時慢(有染料結合時),發生條帶模糊和扭曲現象。嵌入型染料(如EB和本產品)與DNA 結合牢固,則無此現象。
Q:核酸染料是否都有毒性?
A:核酸染料對動物和人的毒性由多方面決定。
一是染料的膜通透性,EB 被歸類為強誘變劑是由于其分子量較小,容易進入細胞內。而EB 二聚體Ethidium Homodimer(EthD)嵌入DNA的能力比EB 強上千倍,但毒性很小,就是由于其分子比EB大,不能透過細胞膜,所以毒性反而更低。SYBR 系列染料雖然低毒,但由于一般都溶于DMSO(因為容易水解,不能使用水溶液做溶劑)中,所以如果濺到皮膚表面,更容易進入皮膚。
二是染料是否容易被人體降解。比如EB在體外就很難降解,一旦進入體內能在人體內殘留的時間可能比較長,增加了毒性;而SYBR Green I等染料(也能以嵌入方式與DNA 結合)由于不穩定,比較容易自然降解,所以毒性自然較低。
三是降解產物是否有毒性,比如用很多方法(如強堿法)降解EB 得到的產物有的比EB 毒性更大,而有的染料降解產物毒性卻低很多,甚至。
四是染料進入細胞核以后是否能跟DNA 結合,很多實驗結果顯示即使EB染料也很難嵌入型到染色體中,因為染色體中的DNA 已經緊密地與各種組蛋白結合。
五是細胞修復突變的能力,正常人體都有很強的修復突變的能力,如修復日光中UV 誘導的DNA突變。總之,一種DNA染料的毒性強弱是多種因素綜合的結果。
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